运输方式有两种。一是用塑料袋充氧运输，一只40×80厘米的塑料袋装放1尾亲鱼充氧运输，可持续12小时左右。亲鱼个体较大时，用双层塑料袋，中间夹一层布袋，可防止亲鱼鳍条刺破塑料袋而造成漏水、漏气。鱼种的装运密度、运输时间与常规鱼运输时一样。另一类运输方式是敞口充氧运输，用活水船或鱼篓加水，途中用空气压缩机充气或直接充入氧气。7～10吨的活水船，可装运250～500公斤鱼运输12小时以上。鱼篓中每立方米水装鱼30公斤可运输24小时。
运鱼的水温宜保持在22℃～28℃之间。水温过高，鱼的耗氧增大，水质变坏快，易造成缺氧死亡;水温过低时，鱼体易冻伤甚至冻死。运鱼水的盐度以2‰～3‰为宜。
运输到达目的地后，容器中的水与放养池中的水的温差不得超过3℃～5℃，应将两者水温调节一致后才能将鱼放入池中。
