池塘是海产养殖动物栖息的场所，也是病原体滋生的场所。池塘环境是否清洁，直接影响到鱼虾等各种海产养殖动物的健康。故清塘消毒是海产养殖工作不可缺少的重要一环，须高度重视。
一、干塘清塘，加固塘基。
有经验的养殖户，在冬季捕鱼后，将塘水排干，挖去一层污泥，然后让阳光曝晒，可达到清除虫害的目的。若因生产需要养过冬鱼虾，未能做到冬季捕完后干塘，可用排污机将塘底污泥抽提一部分，或用竹篓将污泥捞取，用小艇运到岸上，作植物基肥，一举两得，减少塘底的污泥量，有利于减少病原体的滋生繁殖。同时，还应清除塘堤埂披上的杂草，以减少昆虫等产卵的场所。同时加固塘基，预防渗漏。
二、药剂清塘
1、生石灰清塘：在鱼虾池修整后，选择晴天进行生石灰清塘，每亩用生石灰50-100公斤，将干粉均匀干撤到塘底或池底及塘基上，再故入4-6厘米清水，次日用长柄耙将池底淤泥和石灰浆调匀，发挥生石灰的杀毒作用。
有些鱼虾池塘，若清塘清池前无法排水，或原池水排出后又无法补人新水，可以进行带水清塘。每亩水面(1米水深)可用120-150公斤生石灰，装入小艇，加水后变成灰浆，趁热全塘泼洒。
2、菜籽饼清塘：菜籽饼是广东、广西和湖南等地渔民普迫使用的清塘药剂。使用时，先将茶饼捣碎，在桶中用热水浸泡过夜后即可使用，一般每亩用 40-50公斤(1米水深)，浸泡好的菜籽饼加人大量池水后，全池均匀泼洒。最好选择气温高的晴天使用，效果更佳。菜籽饼有施肥作用，但防病效果不如生石灰好。因此，施用菜籽饼后，再用鱼用强力消毒剂或强氯精等消毒药，按每亩水面(1米水深)用0.5-1公斤的剂量，溶于水后，全池泼洒，以杀灭病毒、细菌。
3、漂白粉、强氯精、鱼用强力消毒剂清塘：漂白粉、强氯精、鱼用强力消毒剂等均为含氯消毒剂，具有高效、快速、杀菌力强等特点。漂白粉欠稳定，现生产上趋向于用较稳定的强氯粉和鱼用强力消毒剂。
漂白粉一般按每亩(1米水深)用量为13.5-20.0公斤，将其溶化后全池均匀泼洒。
强氯精和鱼用强力消毒剂，带水清塘一般每亩(1米水深)用1-2公斤施用，溶水后全池泼洒。
用以上方法进行清塘消毒后7天，将池塘水放至所要求的水位，然后按每亩水面(1米水深)用晶体敌百虫500克溶水后全池泼洒，以杀灭水中寄生虫;3天后，用二氧化氯消毒水体，一般每亩(1米水深)用甲、乙各1瓶(500毫升)按说明配好后全池泼洒，2-3天后，等水色转为嫩绿时可放入鱼苗、虾苗。
