小瓜虫病，也被称作白点病，其发病的症状分为初期和后期。
发病初期：锦鲤胸鳍和身上出现小白点，并且迅速的向全身蔓延。
发病后期：身体表面尤如覆盖一层白色薄膜，体表粘液增多，体色暗淡，鱼体消瘦，游动缓慢，常群集于角落或礁石处不断磨蹭，试图摆脱寄生虫。如果寄生虫在锦鲤鳃内，则致使锦鲤无法吸收氧气，到那时即使是大型鱼也会有死亡的时候。
病源及感染原因：一种名叫小瓜虫的绒毛虫是它的病原体，小瓜虫繁殖适宜水温为15至25℃，当水温降到10℃以下或升到28℃时，虫体就会停止发育。
治疗方法：发病初期将水温提高2至4℃，骤然升温会导致小瓜虫死亡，达到不药而愈的目的。如果水温初期在27℃以上，锦鲤仍患上了白点病，除采用升温的办法以外，还可以进行药浴，使用浓度为0.05ppm的孔雀石绿溶液或2ppm的亚甲基蓝溶液，连续数天，直至病情好转。
锚头蚤病：
发病症状：病鱼焦躁不安，食欲减退，鱼体消瘦，游动缓慢，雌虫头部钻入宿主肌肉中，造成肌肉组织的损伤、发炎、形成溃疡。当锦鲤口腔内有大量虫体寄生时，将使口腔有能关闭，因无法摄食而导致鱼类的死亡。
病源：锚头蚤。锚头蚤个体较大，用肉眼就可以看到，易寄生在锦鲤腹部或鳍的根部，锚头蚤寄生部位的鱼鳞，会坚立起来或发红，所以很容易判别。在水温低时，锚头蚤会潜入鱼鳞下过冬，当水温达到大约15℃时，就开始孳生。因此，春季和秋季是锚头蚤的繁殖期。
治疗方法：可以实用镊子直接将虫体拔出，寄生部位用红药水涂抹伤口，然后放入另一干净的鱼盆内，用0.2ppm的敌百虫溶液或3%的食盐浸泡大约30分钟。
鱼虱病：
症状：感染鱼虱的锦鲤焦躁不安，奋力挣扎，急游或擦底，想摆脱虫体，身体会大量的分泌粘液，食欲减退，被咬伤的部位和鱼自身的擦伤会引起感染和水霉。
病源：鱼虱。鱼虱个体较大，可以达到4~5毫米，肉眼即可观看到，锦鲤最容易得的一种寄生虫病，喜欢寄生在大型鱼身上
治疗：用镊子将锦鲤身上的寄生虫逐一拔除后，放入另一干净的鱼盆内，用0.2ppm的敌百虫溶液浸泡约为30分钟。
车轮虫病：
症状：病鱼会做出擦底和缩起鱼鳍的动作。锦鲤鳃部被病原体侵袭后喜欢在水表面或池边游动，身体瘦弱，鱼体色较深。
病源及感染原因：车轮虫引起。主要破坏鳃组织，影响鱼的呼吸，使鱼致死。有时也会利用它的环形齿钩，从由其他原因感染而引起的皮肤增厚处，深深钻到鱼皮的粘膜层裹。
治疗方法：将锦鲤放入另一容器内，每天一次的使用用2%食盐溶液浸洗10分钟。将锦鲤放入另一容器内，进行药浴病鱼使用0.2ppm的敌百虫溶液1小时左右，每天进行一次。
