1、鱼卵运输
虹鳟卵孵化期长，又处在低温的季节，因此，易于运输。
1.1受精卵的运输
卵受精后48～70h期间，水温9～10℃，可以短途运输。将受精卵放入尼龙袋内，每袋装水10L，充氧或滴入30%的双氧水1～2ml，预先将双氧水溶于1L水内，马上加2%硫酸亚铁溶液3～4滴，搅拌后，倒入袋内。每袋可放卵50000粒，水温控制10℃以内，可运输8～10h，成活率可达80%以上。
1.2发眼卵的运输
虹鳟受精卵在发眼后，对环境条件，如机械刺激反应迟钝，这是运输的最佳时机，可以经受长距离运输。运卵箱要求轻巧、保温、保湿，便于携带。可用胶合板制作，长宽各为43cm，高约55cm，箱底要用2cm厚的木板。箱的左右两侧和底部各开一些孔径为1cm的小圆孔。箱底四角固定四个小皮球，防止振动。箱内四周置放泡沫塑料以保温、保湿。每箱可装孵化盘25个，每盘盛卵2000～2500粒，上盖湿纱布1块。最上和最低层的盘，不宜装卵，可放潮湿的水草或冰块。启运前对发眼卵淋水一次。在运输途中，每2～3h淋水一次。箱内温度最好维持在10℃以内;如果温度较高，运输途中就会有部分鱼苗出膜，遭到死亡。箱温和孵化池水温温差不宜大于2℃，待箱温和孵化池水温相近后，才可入池孵化。发眼孵的运输时间可长达3天以上，运输成活率为80%左右，最好时可达90%以上。
2、鱼苗、鱼种运输
虹鳟的耗氧量较高，所以鱼苗、鱼种的运输比较困难。长途运输时，水温必须保持在15℃以内，采用尼龙袋充氧运输。为了保持低温，可以在尼龙袋外面，放置若干小冰袋，小冰袋用食品袋装上冰块即成;如果是鱼篓运输，要备有冰块，需要时可直接置于篓中。
2.1尼龙袋充氧运输
水温10℃左右时，每袋装水7L，放入开食后一个月内的鱼苗700尾，充氧，经42h的运输，成活率可达90%以上。如果运输时间在12h之内，每袋可装1500～2000尾。开食后2个月的鱼苗，每袋可装200～300尾。
2.2开放式送氧运输
如果运输距离不长，可用汽车作开放式送氧运输。方法是：在汽车上置备一个和车箱大下相仿的帆布篓，篓的前方放有氧气瓶1～2个。送氧管用径粗1.5cm的软塑料管做成两个圆圈(圆圈直径约1m左右)，捆上一大小相同的钢盘圈，使送氧管可以沉入篓底。在圆圈的管壁上用针刺有无数放气孔。通过送氧管向鱼篓内不断送氧。每瓶氧气可供10～12h。运输密度：体重50～70g/尾的鱼种，每吨水可放鱼1000尾左右;体重100～120g/尾的鱼种，每吨水可放鱼500～600尾。水温10～12℃，经12h的运输，成活率可达100%。
不论用什么方法运输鱼苗、鱼种，启运前42h内要停止喂食，并作好必要的消毒防疫工作。
