鱼苗和鱼种应规格一致，躯体匀称，背尾饱满，鳞鳍完整无创伤，游动活泼。应在可看到鱼苗鳔点出齐、开口吃食、体呈淡黑色时起运。如运输时间在12小时以上时，体色还应浅些。孵出时间长、体色已经变黑色或鳔点尚看不清的鱼苗，不宜长途运输。鱼种起运前1天～3天必须拉网锻炼，使鱼体预先排空肠内粪便和减少体表粘液，体质结实，习惯密集环境适应长途运输，以提高运输的存活率。
运输鱼苗和鱼种的水温为8℃～22℃，在此范围内温度越低越好。运输鱼苗的水温应控制在10℃～20℃，运鱼种的水温应控制在8℃～15℃。水温在0℃以下时，不宜运输。夏季高温时，可用冰块降温运输。
运输用水要求水质清洁、溶氧量高、无毒无臭味，不受任何污染。途中需要换水时，每次换水量一般不超过1／2，最多不超过2／3，以防止水环境突变。到达目的地下塘时，应测量水温。运输鱼苗的水温与池塘水温相差不得超过2℃，运输鱼种的水温与池塘水温相差不得超过5℃。另外，可以在运输用水中放点食盐，使水的盐浓度达到1.5％，以调节鱼体内外渗透压和防治鱼种外出血及感染；或者预先放入兽用青霉素或链霉素（每立方米水体400万～800万国际单位），以防鱼病发生和运输中水质变坏。
要保证鱼苗和鱼种在运输途中有足够的氧气。除密封充氧外，可用送气、淋水、换水等形式增氧。还可以带氧气瓶充氧和配备双氧水、增氧灵等增氧药品。 在启运前，最好作一次装载密度试验，选择合适的密度作为参考。例如在水温20℃左右、运输需走6小时～8小时的情况下，0.4m3帆布篓可装运鱼苗约12万～15万尾或5cm～7cm的鱼种约1万～1.2万尾。此外，运输时不宜喂饵，以免影响水质和消耗氧气，增加死亡率；低压闷热的天气也不宜运输。
