常见的运输方法有两种：开放式和封闭式。开放式是把鱼种和水放于敞口容器中运输；封闭式指把鱼种放于封闭充氧的容器中运输。两种运输方法使用前都应注意对运输器具消毒，并对鱼种进行拉网锻炼。
一、开放式运输：常见的是帆布袋运输法。帆布袋主要由帆布和铁架组成，一般分方形和圆形两种。方形帆布袋长、宽各86厘米、高100厘米，放水400千克左右，可装夏花鱼种3万尾，适于较短距离运输。
二、封闭式运输：该方法较复杂，设备齐全，条件要求较高，但装运密度大，鱼种成活率高，适于远距离、长时间、大批量运输。常见的是塑料袋充氧运输。塑料袋由高压聚乙烯薄膜做成的圆柱状双层袋，一般直径为25~30厘米，长60~70厘米，一端封死，另一端可供装水、鱼、充气之用。每袋袋水3~5千克（一般装水为袋容积1/3~2/5），可装夏花鱼种1000尾左右。
装运前，先检查塑料袋破损情况。选好袋后，把漏斗插入袋口，按要求装鱼装水，再将输氧管插入袋内水中，轻压塑料袋排净袋内空气，用手抓紧袋口和充氧管，拧开氧气瓶开关，慢充氧至塑料袋鼓起压力达2千克/平方厘米为止。然后关掉氧气瓶开关，抽出充氧管，迅速用橡皮筋把袋口扎紧，停放10~20分钟，无异常后装入纸箱启运。运输途中应注意观察，如发现鱼肚朝上，应立即换水、充氧，并注意适时投饵。运达目的地后，应先测试水温，再分批放养。
