参苗在运输过程中要采取正确的运输方法。运输方法一般有2种，即干运和加水充氧运输
短距离的运输一般采用干运法，参苗出池后，先把参苗放在网袋中将水控干净，但控水时间不宜过长或反复扯抖网袋，否则容易造成参苗擦伤，苗种投放养殖池后，容易导致参苗感染细菌而亡;参苗控水过长过干还可使参苗脱水，也不利于成活应该保持稍有滴水而不成线为好，然后再用大食品方便袋装苗，每袋大约装2～ 3 kg参苗为宜，挤出袋中的空气，将口扎紧，放在保温箱封好运输。较长距离的运输一般采用鱼苗塑料袋，袋内先装人1/3的水，然后装1.5～ 2.5 kg苗，再进行充氧，扎紧塑料袋，然后放在保温箱运输。
苗种运到池边后，首先要进行药浴处理。其方法是用青、链霉素各30×10-6的药液，对参苗药浴30分钟，以防在运输过程中造成苗身的擦伤及细菌感染。放苗时要将参苗均匀地投放在人工礁石上，以提高苗种的成活率。
