一、扁形动物病
此病在每年的1-3月养殖水体温度较低时期(8℃以下)是发病高峰，越冬幼海参培育期和成海参养殖期均有发现，可导致较高的病死率。当水温上升到14℃以上时，病情减轻或消失。发病症状与“刺参腐皮综合征”的症状类似。病参腹部和背部多有溃烂斑块，严重的甚至整块组织烂掉，露出深层组织。大量的扁虫寄生在皮下组织内，造成组织溃烂和损伤。越冬感染的浮游幼体附着力下降易从附着基滑落池底。经解剖后发现患病浮游幼体多数已经排脏，丧失摄食能力。
经检测发现:扁虫感染一般与细菌感染同时存在，而且扁虫多在细菌感染后的病参体上存在，加剧海参的病情，加速海参的死亡。因此，初步断定扁虫也是“刺参腐皮综合征”的致病原之一，属继发性感染。
二、后口虫病
该病在每年的秋冬季节发生率较高，但患病海参的死亡率通常较低。目前仅在幼海参和成海参期发现此病。患病个体外观正常，严重者多有排脏反应，排脏后丧失摄食能力，参体消瘦，活力减弱，容易由其他病原引起继发性感染。
经显微镜镜检和组织病理分析发现：该纤毛虫专性寄生于海参呼吸树，在呼吸树囊膜内外均有大量虫体寄生。寄生虫的头部能钻入呼吸树组织内，造成组织损伤和溃烂，并导致海参排脏。根据活体显微镜观察，结合扫描电镜、银浸法染色的研究结果，初步鉴定该虫是后口虫属中的一种纤毛虫，虫体活体长为40-75微米，宽为20-27微米，其种名有待进一步研究确定。
